Los dolores de cabeza que el hermano François sufría desde hacía mucho tiempo, como consecuencia de las ocupaciones y las exigencias, que se multiplicaron con el número de alumnos,
pasaron a ser crónicos y llegaron a ser tan agudos que el gobierno del Instituto se le hizo casi imposible. El P. Favre, Superior general de la Sociedad de María, que viajó a la Ciudad Eterna, se encargó de presentar el caso ante la Sagrada Congregación de Obispos y Regulares, que aconsejó la elección de un hermano Vicario para ayudar al hermano Superior.1

El 2 de julio de 1860 se hace la convocatoria de un Capítulo general, al que son llamados2 los hermanos estables3. Están presentes, 33 Hermanos estables, número en el que están incluidos los que pertenecen al Régimen, y 3 están ausentes por razones justificadas4.

El nuevo Capítulo general, sin capitulares electos, se abrió con la misma ceremonia que 1852, pero en Saint-Genis-Laval.

El hermano François anunció que, previa consulta al Secretario de la Sagrada Congregación de Obispos y Regulares, y debido a su estado de salud, y a que la administración del Instituto se había hecho cada vez mayor, ha decidido pedir al Capítulo que le descargue de la responsabilidad de la administración del Instituto5. Al mismo tiempo, propone transferir al hermano Louis-Marie la autoridad plena y todas las facultades necesarias para la administración y el gobierno general del Instituto, como Vicario del Superior general.

El hermano Louis-Marie se levantó para reclamar sobre ese modo de nominación, y solicitó una decisión del Capítulo. La votación secreta, propuesta por el hermano Pascal, 3er. Asistente  general, dio como resultado 33 votos a favor de la propuesta del hermano François y 2 en contra. Después de esta votación, el Capítulo en su totalidad y por unanimidad otorgó al  hermano Louis-Marie, todos los poderes del Superior con todas sus responsabilidades6.

A propuesta del hermano Jean-Baptiste, el Capítulo decidió dar al hermano Louis-Marie, recién nombrado Vicario, el título de Reverendo Hermano Superior y al hermano François, Superior dimisionario, el de Muy Reverendo Hermano General.7 

A  partir de ese momento, fue el hermano Louis-Marie quien dirigió el Instituto y asumió el cuidado de todos los asuntos. A pesar de su título oficial, el hermano François no se consideró más que como un superior honorario, considerando al hermano Louis-Marie como su sucesor, a pesar de ser su Vicario.8 Después de los retiros de 1860, se retiró a Nuestra Señora del Hermitage, y aceptó el humilde puesto de Director de la casa en sustitución del hermano Mathieu9.

El Capítulo trabajó en un proyecto para ser estudiado y discutido10, que constaba de los 9 artículos de las Constituciones, que Roma había comunicado como novedades y que había que regular definitivamente, y a éstos se añadieron dos más11.

Se aprovechó esta reunión capitular también para reorganizar las Provincias existentes y para crear otras nuevas, lo que exigió nuevas elecciones12.

La asamblea capitular nombró Asistentes a los hermanos Theophane, director de Valbenoîte-Saint-Etienne; Philogone, director del Noviciado y Chrysogone, director de l’Arbresle13. El Régimen, así organizado, decidió, en 1861, dividir la Provincia Central en dos: la de Saint-Genis Laval y Notre-Dame de lHermitage. La primera fue confiada al hermano Juan Bautista y la de Nuestra Señora del Hermitage al hermano Philogone, las dos de Midi al hermano Pascal y la del Norte al hermano Theophane. El hermano Chrysogone se encargó del noviciado, que siguió siendo común para las provincias de Saint-Genis-Laval y Nuestra Señora del Hermitage.14

En su última circular dirigida a los hermanos, con fecha de 21 de julio de 1860,15 el hermano François publica el acta del tercer Capítulo general: elecciones, estatutos capitulares, etc. Entre los estatutos hay que señalar los siguientes:

– La fiesta del glorioso San José será vacación y se celebrará en la Casa Noviciado como las cinco grandes fiestas de la Virgen.
– No se permite fumar a los hermanos. La necesidad y hábito de fumar son motivo de no-admisión a la profesión.
– Se establece un procuraduría general, con sucursales en las casas del Instituto en número suficiente para que el servicio sea cómodo.

 “El Capítulo desea:
– que se establezca la circunscripción de los distritos y se coloque a un hermano, a ser posible con voto de estabilidad, en la ciudad principal de cada uno de ellos.
– que se envíe a los hermanos un modelo de libro de Anales
– que el Régimen haga elaborar los libros de texto, que se han de producir, y encargue a una comisión la corrección antes de imprimirlos.
– Que se componga un libro, que contenga los temas de meditación , y se entregue a los Hermanos, así como un libro de Oficio15.
“El Capítulo renueva el voto de que los hermanos adopten un catecismo elemental único”17.